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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网上药学学呈现草酸钙肾结石硫化应激性和发炎损坏机制化

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设备最应见的慢性病中的一个。肾组织机构中CaOx多晶体过趋于稳定的堆积会建成肾小管细胞膜挤压伤和凋亡,为了建成肾结石的建成。短链脂肪的堆积酸由肠腔内生物滤池细茵发醇合理营养素材料产生了,不在部分区域肠腔第一道防线中产生出来做用,然而在设备水平面上也产生出来至关重要做用。在当中,丁酸是最很多的短链脂肪的堆积酸,具备消除炎症和免疫检测控制做用,本研究研究丁酸对CaOx肾结石的做用试述潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山卫生院泌尿产科吴忠硕士生导师、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教导、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了互联网药学学售后服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文标题:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 客企业:华山专科医院 学习目标:大鼠、HK-2细胞系 组群相关信息:对比组(Con)、型号组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给出科技:系统临床药理学查重

思绪具体步骤图

实验然而

分析成员首选构筑大鼠对整治,借助身理血生化招生指标和进行疾病学印染等分析策略会发现丁酸行提高CaOx对整治大鼠肾CaOx硫化锌的造成和挫裂伤,减少CaOx对整治大鼠的慢性炎症挫裂伤和钝化化合物的太过表达出。不仅而且,丁酸还可压制草酸诱导型的HK-2受损細胞挫裂伤、钝化应激反应和受损細胞凋亡。 为实验设计丁酸组成和靶什么是DNA组wifi网洛,研究探讨管于于人员从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和立体组成(图1A)。能够 PharmMapper动态动态比对库显示和Uniprot动态动态比对库显示实行处理后共淘汰出11七个丁酸靶什么是DNA组供进十步概述。将什么是DNA组统计数据库文件带到STRING动态动态比对库显示,实行PPIwifi网洛概述。Cytoscape分享了排列的前20的交通联络线靶什么是DNA组的图解wifi网洛图,例如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这交通联络线什么是DNA组与wifi网洛中的的什么是DNA组均表演出某种的管于于性,显示这什么是DNA组应该利用着信息化用途。GO和KEGG概述呈现了丁酸交通联络线什么是DNA组的管于于经过和分子菌物学学功能模块(图1C)。交通联络线什么是DNA组主耍与类固醇生长激素药回复、钝化应激状态不良发生反映回复、活性氧氧氧神经细胞对类固醇生长激素药激励的不良发生反映相应对弱酸性菌物学材质的不良发生反映管于。上述情况所诉,这交通联络线什么是DNA组主耍操作了钝化应激状态不良发生反映和对活性氧氧氧的分子菌物学不良发生反映时候,是肾结石产生长效机制中至关重点的经过,这显示丁酸应该在肾结石中利用重点用途。

图1| 丁酸的结构与靶基因组在线数据分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一大步摸索丁酸对CaOx肾结石确凿切靶遗传人类表观遗传,的科研职工用GEO动态数据资料库对GSE73680中更健康剖析与CaOx肾结石病号的遗传人类表观遗传之间的关系来去了的科研。剖析组与CaOx结石病号的特殊性之间的关系表答遗传人类表观遗传(DEGs)DNA遗传检测标为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个遗传人类表观遗传出现特殊变化规律,里面3379个(89.4%)遗传人类表观遗传表答上浮,404个(10.6%)遗传人类表观遗传表答下跌(图2A)。对DEGs来去聚类分析算法剖析,热图表现了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析算法的特点(图2B)。后来,的科研职工完成GeneCards动态数据资料库劳动力评定了370个已经与CaOx肾结石相应的遗传人类表观遗传,排行前20位的精准预测遗传人类表观遗传极其相应性评定如图如下图所示2C如下图所示。为着找丁酸手术治疗CaOx肾结石的关键性靶点,的科研职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应遗传人类表观遗传整理达到一个Venn图。从而,CYP2C9被设定为丁酸应响CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。虽然,的科研职工还来去了丁酸与CYP2C9的分子结构对接的,CYP2C9的三大氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相护意义,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在采用网格临床药理学估计CYP2C9是丁酸应响CaOx肾结石的靶染色体后,深入分析人员管理还借助内部实验性声明了CYP2C9可下降草酸介导的HK-2内部的ROS情况、炎症病变伤到和凋亡。

图2| 许多据库协同具体分析估计CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶基因遗传

科研结论

本设计1察觉丁酸在身体内和身体内均能调节CaOx肾结石型号的被氧化反应应激反应反应和宫颈发炎伤到,接下来进行手机在线药剂学学选择得出丁酸关系CaOx肾结石的内在的靶点——CYP2C9,后进行人体癌细胞实验报告声明CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2人体癌细胞ROS横向、宫颈发炎伤到和凋亡。一项些察觉是因为丁酸概率进行调节CYP2C9来调节CaOx肾结石的被氧化反应应激反应反应,减小宫颈发炎伤到。一项的时候中拜谱生物技術技術可以提供了手机在线药剂学学技術的服务培训,不但拜谱生物技術技術可提供较为成熟加强的什么是基因组学、淀粉酶质组学、产生组学等几组学物品及技術的服务培训,喜欢拨打资讯! 选取文章:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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